Cíle

Předmětem našeho zájmu je interdisciplinární výzkum metabolismu diferencované i nádorové buňky. Studujeme schopnost buňky přeprogramovat metabolismus jak podle dostupnosti živin, tak podle schopnosti využívat isoformy metabolických enzymů. Schopnost nádorové buňky přeprogramovat energetický metabolismus je jedním ze znaků zhoubného bujení (Hanahan D. & Weinberg R.A., Cell 144: 646-674, 2011).

Našim cílem je porozumět molekulární podstatě patologických změn buněčného metabolismu a odhalit „slabiny“ nádorového metabolismu, které by se mohly stát cílem nádorové terapie. Patologické změny v metabolismu si lze představit jednak jako příčiny a/nebo následky běžných civilizačních či vrozených chorob, například různých typů diabetu.

Volná místa

Potenciální studenti bakalářského, magisterského i doktorského studia si mohou vybírat z aktuálně nabízených témat. Hledáme motivované a kreativní studenty, kteří mají zájem pracovat na vědecky atraktivních tématech pod vedením zkušených pracovníků laboratoře v přátelské atmosféře. V případě zájmu zašlete svůj motivační dopis, stručný životopis (a v případě předchozí práce v laboratoři i doporučení) na e-mail P. Heneberga.

• Aktuálně nabízíme dvě doktorandská místa.

Pro studenty 3. lékařské fakulty nabízíme SVA pro aktuální akademický rok.

Je možné hlásit se do pregraduálního kursu Precizní medicína

V rámci evropského projektu ESF/ERDF jsme během let 2020-22 otevřeli výukovou laboratoř pro pregraduální studenty s moderním vybavením pro molekulárně biologické pokusy. Laboratoř je využívána pro konání každoročního letního blokového kursu CPVL055 (Precision medicine: Practical course of biomedical research) určeného studentům všeobecného lékařství 3. lékařské fakulty i studentům mimofakultním, kde si bude možné vlastnoručně vyzkoušet moderní techniky precizní medicíny.

Kurz zahrnuje širokou škálu přístupů od designu pokusu pomocí bioinformatických nástrojů, analýzu DNA, izolace RNA, přípravu rekombinantních proteinů, měření vlivu mutací na klinicky významné enzymy, práci s tkáňovými kulturami, vybrané analytické metody, závěrečné zpracování dosažených výsledků a kritický rozbor reproducibilních přístupů, ale i chyb vybrané vědecké publikace související s řešenou problematikou. Veškeré úkony předkládáme v klinickém kontextu tak, aby byla zřejmá jejich využitelnost při rutinním kontaktu s pacienty, především na specializovaných klinických pracovištích se zaměřením na pacienty se zhoubným bujením nebo dědičnými onemocněními.

Co aktuálně studujeme?

Zabýváme se objasněním role hexokinas v metabolismu nádorové buňky. Lidská buňka může exprimovat několik isoforem hexokinas v závislosti na typu tkáně. U buněk nejrůznějších typů nádorů dochází ke zvýšení exprese hexokinasy I, popř. hexokinasy II. Ke studiu role isoforem hexokinas využíváme technologie genového inženýrství (CRISPR/Cas9, CRISPRi, transposonový systém Sleeping Beauty, lentiviry), biochemické a molekulárně-biologické metody. Pomocí těchto přístupů sledujeme nejen změny na úrovni metabolických drah, ale také jejich vliv na signální dráhy asociované se vznikem a progresí zhoubného bujení.

Laboratoř je akreditována pro nakládání s geneticky modifikovanými organismy úrovně II, jednotlivé projekty mohou (volitelně) zahrnovat práci s laboratorními zvířaty nebo s buňkami pacientů a dobrovolníků.

Vybrané publikace

1. Heneberg, P.: Diabetes in stiff-person syndrome. Trends Endocrinol Metab. 2023; 34 (10): 640-651. doi: 10.1016/j.tem.2023.07.005.

2. Heneberg, P.: A large portion of diabetes cases in sub-Saharan African populations with HIV represent drug-induced diabetes. Diabetologia. 2023; 66 (6): 1162-1164. doi: 10.1007/s00125-023-05904-9

3. Heneberg, P. (2022): Lactic Acidosis in Patients with Solid Cancer. Antioxid Redox Signal. 37 (16-18): 1130-1152.

4. Šimčíková, D.; Gardáš, D.; Hložková, K.; Hruda, M.; Žáček, P.; Rob, L.; Heneberg, P. (2021): Loss of hexokinase 1 sensitizes ovarian cancer to high-dose metformin. Cancer Metab. 9 (1): 41.

5. Šimčíková, D.; Heneberg, P. (2019): Identification of alkaline pH optimum of human glucokinase because of ATP-mediated bias correction in outcomes of enzyme assays. Scientific Reports 9 (1): 11422.

6. Šimčíková, D.; Heneberg, P. (2019): Refinement of evolutionary medicine predictions based on clinical evidence for the manifestations of Mendelian diseases. Scientific Reports 9 (1): 18577.

7. Těšínský, M.; Šimčíková, D.; Heneberg, P. (2019): First evidence of changes in enzyme kinetics and stability of the glucokinase affected by somatic cancer-associated variations. Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Proteins and Proteomics 1867 (3): 213-218.

8. Heneberg, P. (2019): Redox regulation of hexokinases. Antioxidants & Redox Signaling 30 (3): 415-442.

9. Heneberg, P. (2019): Comment on Mulukutla et al. Autoantibodies to the IA-2 Extracellular Domain Refine the Definition of "A+" Subtypes of Ketosis-Prone Diabetes. Diabetes Care 42 (5): e81.

10. Heneberg, P.; Šimčíková, D.; Čecháková, M.; Rypáčková, B.; Kučera, P.; Anděl, M. (2019): Autoantibodies against ZnT8 are rare in Central-European LADA patients and absent in MODY patients, including those positive for other autoantibodies. Journal of Diabetes and its Complications 33 (1): 46-52.

11. Heneberg, P.; Riegerová, K.; Říhová, A.; Šimčíková, D.; Kučera, P. (2018): Updates on the surface antigens of basophils: CD16 on basophils of patients with respiratory or insect venom allergy and the rejection of CD203c and CD63 externalization decoupling by bisindolylmaleimides. Clinical & Experimental Allergy 49 (1): 54-67.

12. Šimčíková, D.; Kocková, L.; Vackářová, K.; Těšínský, M.; Heneberg, P. (2017): Evidence-based tailoring of bioinformatics approaches to optimize methods that predict the effects of nonsynonymous amino acid substitutions in glucokinase. Scientific Reports 7 (1): 9499.

13. Gandalovičová, A.; Rosel, D.; Fernandes, M.; Veselý, P.; Heneberg, P.; Čermák, V.; Petruželka, L.; Kumar, S.; Moreno, V.S.; Brábek, J. (2017): MIGRASTATICS, the anti-metastatic and anti-invasion drugs: the promise and challenges. Trends in Cancer 3 (6): 391-406.

Lidé – laboratoř je vedena společně Petrem Henebergem a Danielou Šimčíkovou