Laboratoř adaptace metabolismu












            ******************************************************************************************

            *
            ******************************************************************************************
            <style type="text/css"> .titleMain h1 {visibility: hidden; line-height: 0px; margin-bottom

            important;} .leftMainNav {top: 0px !important;} </style>




            ******************************************************************************************
            * Cíle

            ******************************************************************************************
            Předmětem našeho zájmu je interdisciplinární výzkum metabolismu diferencované i nádorové b

            schopnost buňky přeprogramovat metabolismus jak podle dostupnosti živin, tak podle schopno
            isoformy metabolických enzymů. Schopnost nádorové buňky přeprogramovat energetický metabol
            ze znaků zhoubného bujení (Hanahan D. & Weinberg R.A., Cell 144: 646-674, 2011).


            Našim cílem je porozumět molekulární podstatě patologických změn buněčného metabolismu a o
            nádorového metabolismu, které by se mohly stát cílem nádorové terapie. Patologické změny v

            lze představit jednak jako příčiny a/nebo následky běžných civilizačních či vrozených chor
            různých typů diabetu.






            ******************************************************************************************
            * Volná místa
            ******************************************************************************************

            Potenciální studenti bakalářského, magisterského i doktorského studia si mohou vybírat z a
            nabízených témat. Hledáme motivované a kreativní studenty, kteří mají zájem pracovat na vě
            atraktivních tématech pod vedením zkušených pracovníků laboratoře v přátelské atmosféře. V

            zašlete svůj motivační dopis, stručný životopis (a v případě předchozí práce v laboratoři 
            e-mail P. Heneberga [ URL "mailto:petr.heneberg@lf3.cuni.cz"] .
             

            • Aktuálně nabízíme dvě doktorandská místa [ URL "https://www.lf3.cuni.cz/3LF-204.html?
              news=9687&locale=CZ"] .


            Pro studenty 3. lékařské fakulty nabízíme SVA pro aktuální akademický rok [ URL "https://
            www.lf3.cuni.cz/3LF-372.html#1"] .




            ******************************************************************************************

            * Je možné hlásit se do pregraduálního kursu Precizní medicína
            ******************************************************************************************
            V rámci evropského projektu ESF/ERDF jsme během let 2020-22 otevřeli výukovou laboratoř pr

            studenty s moderním vybavením pro molekulárně biologické pokusy. Laboratoř je využívána pr
            každoročního letního blokového kursu CPVL055 (Precision medicine: Practical course of biom
            určeného studentům všeobecného lékařství 3. lékařské fakulty i studentům mimofakultním, kd

            vlastnoručně vyzkoušet moderní techniky precizní medicíny.

            Kurz zahrnuje širokou škálu přístupů od designu pokusu pomocí bioinformatických nástrojů, 

            izolace RNA, přípravu rekombinantních proteinů, měření vlivu mutací na klinicky významné e
            s tkáňovými kulturami, vybrané analytické metody, závěrečné zpracování dosažených výsledků
            rozbor reproducibilních přístupů, ale i chyb vybrané vědecké publikace související s řešen

            Veškeré úkony předkládáme v klinickém kontextu tak, aby byla zřejmá jejich využitelnost př
            kontaktu s pacienty, především na specializovaných klinických pracovištích se zaměřením na
            zhoubným bujením nebo dědičnými onemocněními.





            ******************************************************************************************
            * Co aktuálně studujeme?
            ******************************************************************************************

            Zabýváme se objasněním role hexokinas v metabolismu nádorové buňky. Lidská buňka může expr
            isoforem hexokinas v závislosti na typu tkáně. U buněk nejrůznějších typů nádorů dochází k
            exprese hexokinasy I, popř. hexokinasy II. Ke studiu role isoforem hexokinas využíváme tec

            genového inženýrství (CRISPR/Cas9, CRISPRi, transposonový systém Sleeping Beauty, lentivir
            a molekulárně-biologické metody. Pomocí těchto přístupů sledujeme nejen změny na úrovni me
            ale také jejich vliv na signální dráhy asociované se vznikem a progresí zhoubného bujení.


            Laboratoř je akreditována pro nakládání s geneticky modifikovanými organismy úrovně II, je
            mohou (volitelně) zahrnovat práci s laboratorními zvířaty nebo s buňkami pacientů a dobrov





            ******************************************************************************************
            * Vybrané publikace
            ******************************************************************************************

            1.Heneberg, P.: Diabetes in stiff-person syndrome. Trends Endocrinol Metab. 2023; 34 (10):
              10.1016/j.tem.2023.07.005.
            2.Heneberg, P.: A large portion of diabetes cases in sub-Saharan African populations with 

              drug-induced diabetes [ URL "https://doi.org/10.1007/s00125-023-05904-9"] . Diabetologia
              1162-1164. doi: 10.1007/s00125-023-05904-9
            3.Heneberg, P. (2022): Lactic Acidosis in Patients with Solid Cancer [ URL "https://doi.or

              ars.2021.0267"] . Antioxid Redox Signal. 37 (16-18): 1130-1152.
            4.Šimčíková, D.; Gardáš, D.; Hložková, K.; Hruda, M.; Žáček, P.; Rob, L.; Heneberg, P. (20
              of hexokinase 1 sensitizes ovarian cancer to high-dose metformin [ URL "https://doi.org/

              s40170-021-00277-2"] . Cancer Metab. 9 (1): 41.
            5.Šimčíková, D.; Heneberg, P. (2019): Identification of alkaline pH optimum of human gluco
              because of ATP-mediated bias correction in outcomes of enzyme assays [ URL "https://doi.

              s41598-019-47883-1"] . Scientific Reports 9 (1): 11422.
            6.Šimčíková, D.; Heneberg, P. (2019): Refinement of evolutionary medicine predictions base
              clinical evidence for the manifestations of Mendelian diseases [ URL "https://doi.org/10

              s41598-019-54976-4"] . Scientific Reports 9 (1): 18577.
            7.Těšínský, M.; Šimčíková, D.; Heneberg, P. (2019): First evidence of changes in enzyme ki
              and stability of the glucokinase affected by somatic cancer-associated variations [ URL 

              doi.org/10.1016/j.bbapap.2018.12.008"] . Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Proteins 
              Proteomics 1867 (3): 213-218.
            8.Heneberg, P. (2019): Redox regulation of hexokinases [ URL "https://doi.org/10.1089/

              ars.2017.7255"] . Antioxidants & Redox Signaling 30 (3): 415-442.
            9.Heneberg, P. (2019): Comment on Mulukutla et al. Autoantibodies to the IA-2 Extracellula
              Refine the Definition of "A+" Subtypes of Ketosis-Prone Diabetes [ URL "https://doi.org/

              dc19-0022"] . Diabetes Care 42 (5): e81.
            10Heneberg, P.; Šimčíková, D.; Čecháková, M.; Rypáčková, B.; Kučera, P.; Anděl, M. (2019):
              against ZnT8 are rare in Central-European LADA patients and absent in MODY patients, inc

              positive for other autoantibodies [ URL "https://doi.org/10.1016/j.jdiacomp.2018.10.004"
              Diabetes and its Complications 33 (1): 46-52.
            11Heneberg, P.; Riegerová, K.; Říhová, A.; Šimčíková, D.; Kučera, P. (2018): Updates on th

              antigens of basophils: CD16 on basophils of patients with respiratory or insect venom al
              the rejection of CD203c and CD63 externalization decoupling by bisindolylmaleimides [ UR
              doi.org/10.1111/cea.13288"] . Clinical & Experimental Allergy 49 (1): 54-67.

            12Šimčíková, D.; Kocková, L.; Vackářová, K.; Těšínský, M.; Heneberg, P. (2017): Evidence-b
              of bioinformatics approaches to optimize methods that predict the effects of nonsynonymo
              acid substitutions in glucokinase [ URL "https://doi.org/10.1038/s41598-017-09810-0"] . 

              Reports 7 (1): 9499.
            13Gandalovičová, A.; Rosel, D.; Fernandes, M.; Veselý, P.; Heneberg, P.; Čermák, V.; Petru
              Kumar, S.; Moreno, V.S.; Brábek, J. (2017): MIGRASTATICS, the anti-metastatic and anti-i

              drugs: the promise and challenges [ URL "https://doi.org/10.1016/j.trecan.2017.04.008"] 
              Cancer 3 (6): 391-406.






            ******************************************************************************************
            * Lidé – laboratoř je vedena společně Petrem Henebergem a Danielou Šimčíkovou
            ******************************************************************************************



            *=========================================================================================

            * Petr Heneberg
            *=========================================================================================
            • e-mail: petr.heneberg(zavinac)lf3.cuni.cz [ MAIL "petr.heneberg(zavinac)lf3.cuni.cz"]

            • ORCID: 0000-0002-0703-951X [ URL "https://orcid.org/0000-0002-0703-951X"]
            • ResearchGate: https://www.researchgate.net/profile/Petr_Heneberg [ URL "https://www.rese
              profile/Petr_Heneberg"]

            • Předchozí afiliace: 2008-2011 Ontario Cancer Institute, Toronto, Kanada, 1999-2008 Ústav
              genetiky AV ČR, v.v.i., Praha
            • Člen redakční rady Diabetes Care [ URL "https://care.diabetesjournals.org/"] (2018-2020)

              2015) a Anti-Cancer Agents in Medicinal Chemistry (od 2011)
            • Řešitel grantů GA ČR 15-03438Y (2015-2017), AZV 15-32432A (2015-2019), NU23-06-00045 (20
              P301/12/1686 (2012-2014), IGA MZ ČR NT13663-3 (2012-2014)




            *=========================================================================================
            * Daniela Šimčíková
            *=========================================================================================

            • E-mail: daniela.simcikova(zavinac)gmail.com [ MAIL "daniela.simcikova(zavinac)gmail.com"
            • ORCID: 0000-0002-1227-846X
            • Předchozí afiliace: 06/2021-06/2023 Yale University School of Medicine, New Haven, CT, 0

              European Molecular Biology Laboratory, Heidelberg, Germany, 2009-2013 Mikrobiologický ús
              Praha.
            • Řešitelka grantů GA UK 1428218 (2018-2020) a EMBO Short-term Fellowship (2019).



            *=========================================================================================

            * Magisterští studenti
            *=========================================================================================
            Dominik Gardáš, Tomáš Pelikán, Vojtěch Charvát a Robert Žak – naši studenti prezentují kaž

            své práce na fakultní konferenci SVK. Např. v r. 2021 se na na této konferenci umístili na
            a 2. v teoretické posterové sekci; konkrétně Vojta za poster „Membránový přenašeč xCT/SLC7
            regulátorem proliferace buněk ovariálního karcinomu“ a Tomáš za poster „Exprese glutamináz

            mTOR signalizaci v ovariální nádorové linii TOV-21G“. Výsledky prací následně prezentují i
            konferencích, r. 2021 např. Dominik prezentoval své výsledky na Cold Spring Harbor Laborat
            Biology of Cancer: Microenvironment & Metastasis.





            *=========================================================================================
            * Aktuální spolupráce
            *=========================================================================================

            • prof. Roman Zachoval (FTN, Urologická klinika) – výzkum metabolismu buněk světlobuněčnýc
            • prof. Lukáš Rob (FNKV, Gynekologicko-porodnická klinika), dr. Kateřina Hložková (FN Moto
              dětské hematologie a onkologie) - výzkum metabolismu buněk nádorů ovária a endometria.

            • dr. Miroslav Veith (FNKV, Oftalmologická klinika), dr. Jaroslava Dusová (FN Hradec Králo
              klinika), dr. Veronika Matušková (FN Brno, Oční klinika), dr. Jan Němčanský (FN Ostrava,
              výzkum nových typů autoprotilátek u pacientů s diabetickým makulárním edémem.