V centru zájmů a odborností CZEM je propojení medicínských vědomostí a principů evidence based medicine se schopností ekonomických analýz (včetně zpracování rozsáhlých souborů zdravotnických dat) a praktickou znalostí reálného fungování českého a dalších zdravotních systémů. Z toho vyplývají kompetence především v následujících oblastech:

• Úhradové mechanismy a kontrakty mezi plátci a poskytovateli, včetně kontraktů sdílejících riziko

• Výzkum poskytování zdravotních služeb - analýzy chování poskytovatelů, hodnocení kvality a efektivity

• Programy disease managementu, klinické protokoly a další nástroje standardizace a integrace zdravotní péče sloužící k omezení dopadu chronických nemocí, včetně motivačních systémů pro pacienty

• Financování zdravotních systémů, včetně dopadu stárnutí obyvatelstva, kompenzace rizika (přerozdělení vybraného pojistného) a financování dlouhodobé péče