Biologie a patologie buňky ****************************************************************************************** * ****************************************************************************************** Biologie a patologie buňky je biomedicínský vědní obor zaměřený na stavební a funkční char jednotlivých buněk a jejich vzájemnou součinnost při stavbě tkání a orgánů. Předmětem stud první řadě buňka samotná na různých úrovních její funkční organizace, přičemž se přihlíží provázání strukturně-funkčních úrovní, které udržují buňku jakožto základní stavební a fun mnohobuněčných organizmů vč. člověka. Cílem studia ve studijním programu Biologie a patologie buňky je připravit studenta k samo výzkumné práci směřující k objasnění dynamiky, vzájemných vztahů a funkčně-strukturální ch buněk a tkání za normálních – fyziologických okolností a při patologických procesech, jako modelování. Studijní povinnosti 1) Po přijetí vypracovat individuální studijní plán (ISP), který musí být schválen školite programu. 2) Po uplynutí každého akademického roku provést spolu se školitelem hodnocení ISP a odevz příslušných termínech k dalším posouzení OR a ke schválení garantem programu. 3) Absolvování těchto kurzů: • B90019 Pokroky v biologii buňky – povinný kurz – organizován OR Biologie a patologie buň • B90041 Pokroky v molekulární biologii a genetice – povinný kurz – pořádá ÚMG AV ČR • Doporučují se případně jakékoliv další kurzy organizované oborovými radami se zaměřením studentovu programu. Je vhodné zařadit také kurzy pořádané Univerzitou či Akademií věd, získá vědomosti a dovednosti nezbytné pro úspěšnou prezentaci výsledků, práci s odbornou vědeckými databázemi a pro získávání grantů. 4) Jazyková zkouška z angličtiny (zkouška na Ústavu dějin lékařství a cizích jazyků, státn zkouška nebo mezinárodně uznávaná jazyková zkouška, např. TOEFL, Cambridge Certificate). D jazyky jsou nepovinné. 5) Státní doktorská zkouška Kurzy vypsané OR Biologie a patologie buňky:  B90019 Pokroky v biologii buňky [ URL "3LF-2001-version1-biologie_a_patologie_bunky.pdf"] B90041 Pokroky v molekulární biologii a genetice [ URL "https://pokroky.img.cas.cz/"] Oborová rada Biologie a patologie buňky (OR 02) vyžaduje účast ve dvou přednáškových kurze biologii buňky a Pokroky v molekulární biologii a genetice). Kromě těchto kurzů se může do dalších přednáškových nebo praktických kurzů organizovaných např. jinými oborovými radami. 1) POKROKY V BIOLOGII BUŇKY (přednáškový kurz) Kurz je povinný. Kurz se koná každý druhý r polovině kalendářního roku. Program kurzu Pokroky v biologii buňky v roce 2023 Přihlášku do kurzu zasílejte paní Ivaně Buckové na emailovou adresu ivana.buckova@lf1.cuni Garant kurzu: Doc. MUDr.Tomáš Kučera Ph.D. Ústav histologie a embryologie 1. LF UK Alberto Praha 2, tel.:224968130, email:tkucer@lf1.cuni.cz Popis: Jedná se o cyklus přednášek v rozsahu 24 hodin (1x týdně 4 přednášky, po dobu 4 týd hod.; program přednášek zahrnuje hodinovou a dvě 15-minutové přestávky). Cyklus tvoří před odborníků v oboru buněčné biologie a patologie z Univerzity Karlovy a ústavů Akademie věd ústavů. Přednáškový cyklus poskytne doktorandům nejnovější poznatky z oboru biologie a pat Přednášky se týkají strukturně-funkční organizace buňky a tkání se zdůrazněním významu zák a současně klinického výzkumu (např. onemocnění genetická, onemocnění metabolická, onemocn systému). Doporučená literatura: • Alberts B. et al.: Molecular Biology of the Cell (6th edition), 2014, WW Norton Co • Alb Essential Cell Biology (5th edition), 2020, WW Norton Co • Alberts B. a kol.: Základy buně Úvod do molekulární biologie buňky (2. vydání), 2005, Espero Publishing • Pollard T. D., E Lippincott - Schwartz J.: Cell Biology, (3rd edition), 2016, Elsevier • Lodish H. et al.: Biology (8th edition), 2016, W. H. Freeman and Co. • Weinberg R. A.: The Biology of Cancer 2013, Garland Science • Elleder M. a Sikora J.: Biologie buňky, 2008 • A.L.Mescher: Junqui histologie, 14. vydání, 1. české, Praha, Galén, 2018 • Hořejší V. a kol.: Základy imunolog aktualizované vydání, Triton, Praha. ISBN: 978-80-7553- 250-3 • Masopust J. a kol.: Patobi 2003, Univerzita Karlova, 2. LF, Praha. • Povýšil C., Šteiner I. a kol.: Obecná patologie Praha. ISBN: 9788072627738 • Zámečník J. a kol.: Patologie I-III, 1. vydání, 2019, LD Prag POKROKY V MOLEKULÁRNÍ BIOLOGII A GENETICE viz odkaz https://pokroky.img.cas.cz Požadavky na tvůrčí činnost Prvoautorská publikace. Podíl na výzkumném grantu. Požadavky na absolvování stáží Předpokládá se alespoň jedna měsíční či delší zahraniční stáž. Lze nahradit účastí na mezi nebo jinou formou přímého zapojení do spolupráce se zahraničím, podle možností a uvážení š Další studijní povinnosti Účast na národních a mezinárodních sjezdech. Je doporučena výuka pregraduálních studentů. Státní doktorská zkouška Podmínky pro zahájení zkoušky: 1) Zkoušku je nutno skládat před odevzdáním disertační práce a po splnění podstatné části studijního plánu. Je doporučena aspoň jedna publikace k tématu dizertace s autorským podíl 2) Absolvování obou povinných kurzů: Pokroky v biologii buňky a Pokroky v molekulární biol 3) Jazyková zkouška z angličtiny. Oborová rada doporučuje typ jazykové zkoušky s mezinárod (TOEFL, Cambridge), studijní řády fakult však připouštějí vykonání jazykové zkoušky na fak jazyků a umožňují též uznání státní jazykové zkoušky z angličtiny. Průběh zkoušky: V první části zkoušky přednese student zhruba 15 minutovou přednášku o vlastních výsledcíc práce dosažených během dosavadního studia. Poté členové komise požádají studenta o zodpově souvisejících s dosaženými výsledky. V druhé části zkoušky student odpovídá na 3 otázky, k ze zveřejněného seznamu otázek, které pokrývají tyto základní tematické okruhy: A. Buněčná a molekulární biologie Základní chemické složení buňky a buněčný metabolismus Genom a genová exprese DNA – replikace, transkripce; RNA – typy, sestřih Biologické funkce proteinů – enzymy Buňka – typy (eukaryota, prokaryota, rostlinná vs. živočišná buňka) a základní organizace Stavba a funkce biologické membrány a buněčných organel Buněčné jádro – stavba, funkce, patologie Buněčný transport Cytoskelet – komponenty a jejich funkce Buněčný cyklus a buněčné dělení, buněčná smrt Kmenové buňky a buněčná diferenciace Základní typy tkání Mezibuněčná komunikace, buněčná adheze a pohyb Stavba a funkce mezibuněčné hmoty B. Základy metod pro vyšetřování buněk a tkání Mikroskopická technika - světelný a elektronový mikroskop, pokročilé mikroskopické metody Metody histochemie, imunocyto – a histochemie Základy molekulárně-genetických metod – PCR, sekvenování, in situ hybridizace Přehled biochemických metod v buněčné biologii – blotovací metody Modelové organismy, tkáňové a buněčné kultury C. Obecná patologie buněk a tkání Regresivní změny buněk a tkání Zánět a přehled obranné reakce organismu Interakce buněk s patogeny Regenerace a reparace tkání, metaplasie Nádorová transformace buňky, základní druhy nádorů Fyziologická a patologická novotvorba cév Buněčně-biologické základy kardiovaskulárních a metabolických chorob Doporučená literatura: Alberts B. et al.: Molecular Biology of the Cell (6th edition), 2014, Garland Science Alberts B. et al.: Essential Cell Biology (4th edition), 2016, Garland Science Alberts B. a kol.: Základy buněčné biologie: Úvod do molekulární biologie buňky (2. vydání Publishing Pollard T. D., Earnshaw W. C., Lippincott - Schwartz J.: Cell Biology, (3rd edition), 2016 Lodish H. et al.: Molecular Cell Biology (8th edition), 2016, W. H. Freeman and Co. Weinberg R. A.: The Biology of Cancer (2nd edition), 2013, Garland Science Elleder M. a Sikora J.: Biologie buňky, 2008 Elleder M.: Vybrané kapitoly z patologie buňky I, 1997, Karolinum, Praha. Elleder M.: Vybrané kapitoly z patologie buňky II, 1999, Karolinum, Praha. A.L.Mescher: Junquierovy základy histologie, 14. vydání, 1. české, Praha, Galén, 2018 Masopust J. a kol.: Patobiochemie buňky, 2003, Univerzita Karlova, 2. LF, Praha. Sambrook J. et al: Molecular cloning: A laboratory manual/Joseph Sambrook, David W. Russel Cold Spring Harbor, NY: Cold Spring Harbor Laboratory, c2001. Povýšil C., Šteiner I. a kol.: Obecná patologie 2011, Galén, Praha. ISBN: 9788072627738 Hořejší V. a kol.: Základy imunologie 2015, Triton, Praha. ISBN: 978-80-7387-713-2 Podmínky pro zahájení obhajoby: 1) Splnění všech výše zmíněných studijních povinností vč. složení státní doktorské zkoušky 2) Autorství (spoluautorství) minimálně dvou původních vědeckých prací k tématu dizertační publikovaných nebo přijatých k publikaci v mezinárodně uznávaném časopise s impakt-faktore Science), alespoň u jedné publikace musí být student prvním autorem.