Biochemie a patobiochemie ****************************************************************************************** * ****************************************************************************************** Cílem studia ve studijním programu Biochemie a patobiochemie je připravit studenta na samo objasňování molekulárních principů životních dějů v lidském organizmu, jejich řízení a mol mechanizmů jejich poruch. Biochemie a patobiochemie se zabývá problematikou biomakromolekul, tj. bílkovin a enzymů, lipoproteinů a nukleových kyselin, jakož i jejich stavebních jednotek a dalších významných nízkomolekulárních látek v živých soustavách (aminokyselin, peptidů, sacharidů, lipidů, st oboru je i objasňování jejich vzájemné přeměny a jejich úlohy v buněčné signalizaci. Velmi oblastí je též výzkum nadmolekulárních buněčných struktur a jejich funkce. SP se soustřeďu principy poruch uvedených struktur a jejich funkcí, tedy na molekulární podstatu vzniku, r průběhu chorobných stavů. Významnou součástí studia je fyziologický a patogenetický význam forem kyslíku a dusíku, předmětem SP jsou mechanizmy působení látek poškozujících nukleové a biomembrány. Ve SP je věnována pozornost výzkumu poruch buněčné signalizace včetně kance atherogeneze. Molekulární podstaty dědičných a získaných metabolických poruch, mechanismů vnitřního prostředí (metabolické a iontové rovnováhy) a s tím spojených patologických odch zabývá vývojem nových laboratorních diagnostických metod. Kurzy vypsané OR Bioechemie a patobiochemie: • B90008 Vybrané kapitoly z biochemie a patobiochemie [ URL "https://www.lf1.cuni.cz/docum vybrane-kapitoly-z-biochemie-a-patobiochemie.pdf"] • B90203 Novinky v biomedicínském výzkumu [ URL ""] • DS001 Kurz základů vědecké činnosti [ URL "https://www.lf2.cuni.cz/aktuality/kurz-zaklad cinnosti-2020-2021"] Studijní povinnosti  1.Po přijetí vypracovat individuální studijní plán, jeho schválení školitelem a garantem p 2.Absolvování nejméně dvou kurzů organizovaných oborovou radou Biochemie a patobiochemie n radou doktorských studijních programů v biomedicíně. 3.Jazyková zkouška 4.Státní doktorská zkouška (doporučena v 1. – 2. roce studia, podmínky uvedeny níže) Požadavky na tvůrčí činnost Prvoautorská publikace, PI grantu typu GAUK. Požadavky na absolvování stáží Doporučena alespoň jedna měsíční či delší zahraniční stáž. Další studijní povinnosti Účast na národních a mezinárodních sjezdech. Státní doktorská zkouška Podmínky pro zahájení zkoušky: 1.Absolvování nejméně dvou kurzů organizovaných oborovou radou Biochemie a patobiochemie n radou doktorských studijních programů v biomedicíně. 2.Jazyková zkouška z angličtiny. Oborová rada doporučuje typ jazykové zkoušky s mezinárodn (TOEFL, Cambridge), studijní řády fakult však připouštějí vykonání jazykové zkoušky na f jazyků a umožňují též uznání státní jazykové zkoušky z angličtiny. 3.Státní doktorská zkouška se koná zásadně vždy před odevzdáním a obhajobou disertační prá Průběh: Uchazeč představí své téma v 10–15 minutovém slovním sdělení. Komise položí 4–6 otázek. Na jednání komise vyhodnotí průběh zkoušky a stanoví klasifikaci. Studentovi je oznámen výsle komise podepíší protokol o zkoušce. Důležité sdělení od předsedy oborové rady BICH, pana prof. MUDr. Z. Kleibla, Ph.D.: Studenti přihlášení ke státní doktorské zkoušce mohou představit témata své postgraduální prezentace v maximální délce 10 minut, doplněné nejvýše 7 snímky (se zaměřením na metodick PowerPointu). V takovém případě se dostaví ke zkoušce s prezentací na flash discu ve formá Zkušební otázky: Obecné biochemické okruhy • Souvislost struktury, biomolekul s jejich vlastnostmi a funkcemi - bílkoviny, nukleové k sacharidy, lipidy. • Metabolizmus sacharidů a lipidů z hlediska bioenergetiky. • Enzymy – mechanizmy působení, kinetika, regulace aktivity • Biosyntéza a rozklad aminokyselin, jejich přeměny na specializované biomolekuly- porfyri barviva. Neurotransmitery, hormony. • Biochemie přenosu genetické informace (enzymologie nukleových kyselin). • Proteosyntéza • Regulace genové exprese • Molekulární principy intracelulární buněčné signalizace. • Molekulární principy mezibuněčné komunikace. Nadmolekulární biochemie • Struktura membrán a buněčných organel • Cytoskelet • Extracelulární matrix • Funkce buněčných organel (Golgiho aparát, endoplazmatické retikulum, lysosomy, mitochond • Membránový transport • Buněčný cyklus a jeho regulace, nádorové bujení • Apoptóza Příklady speciálních okruhů (podle zaměření doktoranda) Metodika: • Izolace a purifikace biomolekul • Imunochemické metody • Sekvenování proteinů a nukleových kyselin • Manipulace s nukleovými kyselinami, génové inženýrství • Izolace buněk, buněčné kultury • Spektrofotometrie Další otázky dle tématu disertace - stanoveny zkušební komisí a školitelem. Doporučená literatura: Vysokoškolská učebnice lékařské biochemie např. Harperova ilustrovaná biochemie, Murray R. K. a kol. Medical Biochemistry, J. Baynes, M. Dominiczak Molecular Biology of the Cell, Bruce Alberts [ URL "https://www.amazon.com/s/ref=dp_byline ie=UTF8&text=Bruce+Alberts&search-alias=books&field-author=Bruce +Alberts&sort=relevancerank"] Podmínky pro zahájení obhajoby Státní doktorská zkouška, nejméně dvě původní práce, týkající se tématu disertační práce s impaktem alespoň jedna. Na jedné z nich je uchazeč uveden jako první autor. Připouští se s prvouatorství s dalším spolupracovníkem, pokud publikace má IF alespoň 4,0.