Laboratoř metabolismu a bioenergetiky ****************************************************************************************** * ****************************************************************************************** [Page in English] [ URL "http://www.lf3.cuni.cz/3LFEN-386.html"] V Laboratoři metabolismu a bioenergetiky se zabýváme výzkumem mitochondriální funkce a dys k lidskému zdraví a nemoci. Naše projekty se zaměřují na vliv dostupnosti živin, gluko- a souvislosti s metabolickým syndromem a diabetem 2. typu, oxidativní stres a poškození mtDN kosterního svalu a nádorových buněk a vliv léků a environmentálních faktorů na mitochondri Byli jsme první laboratoří v ČR, která začala pracovat na přístroji Seahorse měřícím buněč a glykolýzu, díky čemuž máme unikátní expertízu a zkušenosti v analýze buněčného metabolis laboratoř dále využívá, kromě standardních molekulárně biologických metoda, také konfokáln mikroskopii, celou řadu bioenergetických metod, metabolomiku či enzymologické a biochemick Spolupracujeme na projektech také s kolegy a kolegyněmi z Fakultní nemocnice Královské Vin dalších institucích. Pro akademický rok 2020/21 nabízíme dvě doktorandská místa v oblasti nádorového metabolism www.lf3.cuni.cz/3LF-204.html?news=3861&locale=CZ"] (podávání přihlášek do 30.4.2020) Vedoucí: doc. MUDr. Jan Trnka, Ph.D., M.Phil., M.Sc. e-mail [ MAIL "jan.trnka(zavinac)lf3. [ URL "http://orcid.org/0000-0002-1786-7562 "] Odborné asistenky/asistenti: ing. Stanislava Martínková, Ph.D. Post-doc: MUDr. Adéla Krajčová, Ph.D. Mgr. Zdeňka Syrová, Ph.D. Doktorandky/di: Mgr. Anežka Kafková Alumnae/i: Mgr. Jana Tůmová (Patková), Ph.D. (2009-2016) Moustafa Elkalaf, MBBCh, Ph.D. (2009-2019) Naše recentní publikace: J. Fontana, S. Martínková, J. Petr, T. Žalmanová, J. Trnka. Metabolic cooperation in the o Physiol. Res. 69: 33-48, 2020; doi: 10.33549/physiolres.934233 Moráň Lukáš; Pivetta Tiziana; Masuri Sebastiano; Vašíčková Kateřina; Walter Franziska; Pre Elkalaf Moustafa; Trnka Jan; Havel Josef; Vaňhara Petr. Mixed copper(ii)-phenanthroline co cell death of ovarian cancer cells by evoking the unfolded protein response. Metallomics,1 Verlande Amandine; Krafčíková Michaela; Potěšil David; Trantírek Lukáš; Zdráhal Zbyněk; El Trnka Jan; Souček Karel; Rauch Nora; Rauch Jens; Kolch Walter; Uldrijan Stjepan. Metabolic ERK activity by controlling KSR-RAF heterodimerization. EMBO Reports, 19,2,320-336 Krajčová Adéla; L?vsletten Nils G.; Waldauf Petr; Frič Vladimír; Elkalaf Moustafa; Urban T Michal; Trnka Jan; Thoresen G. Hege; Duška František. Effects of Propofol on Cellular Bioe Human Skeletal Muscle Cells. Critical Care Medicine, 46,3,e206-e212 Gojda Jan; Rossmeislová Lenka; Straková Radka; Tůmová Jana; Elkalaf Moustafa; Jaček Martin Potočková Jana; Krauzová Eva; Waldauf Petr; Trnka Jan; Štich Vladimír; Anděl Michal. Chron exposure to branched chain amino acids impairs glucose disposal in vegans but not in omniv Journal of Clinical Nutrition,71,5,594-601 Elkalaf, M.; Weiszenstein, M.; Polák, J.; Trnka, Jan: Mitochondrial Probe Methyltriphenylp (TPMP) Inhibits the Krebs Cycle Enzyme 2-Oxoglutarate Dehydrogenase. PLoS One, 2016, 11(8) 10.1371/journal.pone.0161413. Jiroutková, K.; Krajčová, A.; Žiak, J.; Fric, M.; Gojda, J.; Džupa, V.; Kalous, M.; Tůmová Jan; Duška, F.: Mitochondrial Function in an In Vitro Model of Skeletal Muscle of Patients Critical Illness and Intensive Care Unit-Acquired Weakness. J. Parenter. Enter. Nutr., 201 29, 2016(v tisku): DOI: 10.1177/0148607116657649. Tůmová, J.; Anděl, M.; Trnka, Jan: Excess of free fatty acids as a cause of metabolic dysf skeletal muscle. Physiol. Res., 2016, 65(2): 193-207. Weiszenstein, M.; Pavlíková, N.; Elkalaf, M.; Halada, P.; Šeda, O.; Trnka, Jan; Kovář, J.; The Effect of Pericellular Oxygen Levels on Proteomic Profile and Lipogenesis in 3T3-L1 Di Preadipocytes Cultured on Gas-Permeable Cultureware. PLoS One, 2016, 11(3): e0152382. DOI: journal.pone.0152382. Weiszenstein, M.; Mušutová, M.; Plíhalová, A.; Westlake, K.; Elkalaf, M.; Koc, M.; Procház J.; Gulati, S.; Trnka, Jan; Polák, J.: Adipogenesis, lipogenesis and lipolysis is stimulat not severe hypoxia in 3T3-L1 cells. Biochem. Biophys. Res. Commun., 2016, 478(2): 727-732. j.bbrc.2016.08.015. Dudák, J.; Žemlička, J.; Krejčí, F.; Polanský, Š.; Jakubek, J.; Mrzílková, J.; Patzelt, M. ray micro-CT scanner for small animal imaging based on Timepix detector technology. Nucl. Phys. Res. A, 2015, 773(February): 81-86. DOI: 10.1016/j.nima.2014.10.076. Finichiu, P.G.; Larsen, D.S.; Evans, C.; Larsen, L.; Bright, T.P.; Robb, E.L.; Trnka, Jan; James, A.M.; Smith, R.A.; Murphy, M.P.: A mitochondria-targeted derivative of ascorbate: M Biol. Med., 2015, 89(12): 668-678. DOI: 10.1016/j.freeradbiomed.2015.07.160. Jiroutková, K.; Krajčová, A.; Žiak, J.; Fric, M.; Waldauf, P.; Džupa, V.; Gojda, J.; Němco Kovář, J.; Elkalaf, M.; Trnka, Jan; Duška, F.: Mitochondrial function in skeletal muscle o protracted critical illness and ICU-acquired weakness. Crit. Care, 2015, 19(1): Article 44 s13054-015-1160-x. Krajčová, A.; Žiak, J.; Jiroutková, K.; Patková, J.; Elkalaf, M.; Džupa, V.; Trnka, Jan; D Normalizing Glutamine Concentration Causes Mitochondrial Uncoupling in an In Vitro Model o Muscle. J. Parenter. Enter. Nutr., 2015, 39(2): 180-189. DOI: 10.1177/0148607113513801. Pavlíková, N.; Weiszenstein, M.; Pala, J.; Halada, P.; Šeda, O.; Elkalaf, M.; Trnka, Jan; J.: The effect of cultureware surfaces on functional and structural components of differen preadipocytes. Cell. Mol. Biol. Lett., 2015, 20(5): 919-936. DOI: 10.1515/cmble-2015-0054. Trnka, Jan; Elkalaf, M.; Anděl, M.: Lipophilic triphenylphosphonium cations inhibit mitoch transport chain and induce mitochondrial proton leak. PLoS One, 2015, 10(4): e0121837. DOI journal.pone.0121837. Tůmová, J.; Mališová, L.; Anděl, M.; Trnka, Jan: Protective Effect of Unsaturated Fatty Ac Acid-Induced Toxicity in Skeletal Muscle Cells is not Mediated by PPAR delta Activation. L 50(10): 955-964. DOI: 10.1007/s11745-015-4058-0. Patková, J.; Anděl, M.; Trnka, Jan: Palmitate-Induced Cell Death and Mitochondrial Respira in Myoblasts are Not Prevented by Mitochondria-Targeted Antioxidants. Cell. Physiol. Bioch 1439-1451. DOI: 10.1159/000358709. Elkalaf, M.; Anděl, M.; Trnka, Jan: Low Glucose but Not Galactose Enhances Oxidative Mitoc Metabolism in C2C12 Myoblasts and Myotubes. PLoS One, 2013, 8(8): e70772. DOI: 10.1371/ journal.pone.0070772. Gojda, J.; Patková, J.; Jaček, M.; Potočková, J.; Trnka, Jan; Kraml, P.; Anděl, M.: Higher sensitivity in vegans is not associated with higher mitochondrial density. Eur. J. Clin. N 67(12): 1310-1315. DOI: 10.1038/ejcn.2013.202.